FAT32 jest kolejną odmianą systemu plików FAT po raz pierwszy zastosowany w systemie operacyjnym Windows 95. W porównaniu do swojego poprzednika, "nowy" FAT32 mógł osiągnąć 16 razy większą liczbę klastrów niż FAT16, co bardzo rozszerzyło funkcjonalność systemów plików. W rzeczywistości taka ilość jest nie możliwa w użyciu ze względu na zaprogramowane blokady w systemach firmy Microsoft.
Tak samo FAT32 pomimo swojej wartości liczbowej, która mówi, że wykorzystuje on 32 bity, faktycznie używane jest ich 28, dlatego wielkość dysku obsługiwanego w tym systemie plików nie może przekroczyć 125 gigabajtów.
W dzisiejszych czasach na rynku oferowane są dyski większe niż podana wartość, więc można wywnioskować z tego, że trzeba było zaplanować jakiś nowy system plików, który mógłby funkcjonować na nowych wytworach postępu technologii. W momencie powstania, był on wyraźnie lepszy od swojego poprzednika - FAT16, jednak z powodu swoich ograniczeń został zastąpiony systemem NTFS, który był jego następcą.